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听说押井守有能力把一个小小的企划搞成复杂的世界观设定和繁杂的故事脉络。我现在倒是面临着类似的困境——会不会把一个小小的Review作业搞成一个庞大的review而无法完工呢？

Review寫作湊頁數心得

• 沒有規定字號，就選大的。沒有規定行間距，就自選兩倍半的。沒有規定頁邊距，就自己往中間壓榨一下。
• 回車分段。正文首字母下沉？
• 列表上下文縮進厲害一些。
• 引用使用哈佛格式，而且，人名長的可以多多引幾次。（這樣，引用都是（James，2007）的樣子了。所以人名長一些吃香）
• 待續……
  

It shouldn't be named Forkhead

but fuckhead!

激酶会武术，谁也挡不住

前几天看到Nature的文章，说是老鼠的cdk1自己就可以撑过细胞周期。S期的几个激酶——cdk4/cdk6/cdk2都被敲掉了，而cdk1则独当一面，把有丝分裂进行到底。也许现行的哺乳动物细胞周期调控要重写了。

原来利根川進的姓是“利根川”

利根川原来是日本流域面积最广的河流。原以为诺贝尔奖的得主是姓“利根”的呢。圡啦！

楷模啊！学生物当如是！

发信人: crystaler (民工), 信区: Biology
标 题: 忏悔录--大概做生物的PHD 我算是最轻松的了
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Jun 7 06:02:29 2007)

看到板上的兄弟姐妹们那么辛苦 先BS一下自己

因为老板巨nice 我一般上午都是睡眠中度过的 中午和朋友出去找饭馆吃饭1-2个小时不等回到实验室后花至少一个小时时间浏览文学城和买卖提 看的头晕眼花就去喝午后茶抽午后烟 回来开始工作 2-3小时 大部分都是装样子 然后就去健身房了 两个小时候回家做饭吃饭 晚上或者看电视 找朋友玩 发呆 聊天等等 或者去实验室工作2-3小时（各占50%）

周末不是吃饭喝酒就是打牌 偶尔去酒吧club（除非当时有工作任务 我比较想尽早做完）篮球足球跆拳道 全年都有各种比赛 美国除了阿拉斯加 想玩的地方也基本都去了 中间回了4次国 除了一次是公费开会（大部分时间其实都去K歌、喝酒、三里屯了） 其余都在5周以上

我的工作分两部分 一半需要做bench 一年估计做个5-10次吧 每次搞个几天 这几天算是辛苦的 都要超过8小时的工作量 虽然不是连续工作另一半是数据处理 刚入行的时候一套数据要搞小半年 现在熟了 一次连续5小时工作一周之内肯定搞定了 有个2-4套数据就可以出一个paper了

读paper这种事情 自从发现了（白天读paper打瞌睡 晚上读paper睡得香）这个定理就再也不看了（除非要写东西 或者确实和我的课题比较相关的文章还多半是老板发给我的）如今 一作发了一篇biochemistry 刚投了一篇JACS（老板说这么大的数据量肯定会接收的 虽然我也不sure）合作的发了一篇 还有两篇二作 板上钉钉的 基本工作都完成了 前几年期间还有莫名其妙的以前在国内当小本的时候被挂名的文章出来 而且是我所有文章里面IF最高的 （一篇是nature） 汗一个

最BS自己的是 没有一篇是我写的 我们实验室写作工作都是老板搞 丫文笔巨好 我只管着写实验部分（拿着以前的稍微改动一下） 和做图（这个还多少有点工作量）写完了给我proofreading 我也懒得看 有空看好了 老板说早就投了 就是写过qualify
proposal， 还被老板改得面目全非（不过丫直接在word文档改的 我把他highlight的部分格式改过来就好了） 这次给我改thesis （由我发的文章内容拼凑而出 所以基本上就是开头和结尾要写）因为他是打印出来在飞机上改的 给我的时候还不好意思 怕我看不懂他的笔记

我们实验室人少 而且女性之间都有矛盾 所以开了两次不成功的lab meeting之后 老板再也不开了 而且我还属于两个系联合培养 说实在 就是两个系哪里有吃的玩的活动 我就去 哪里有麻烦事情 我就不去 反正都有借口本来可以四年毕业的（那时候已经有一篇一作了 符合毕业标准了） 但是老板一度假前后就去了一年 每两个月回来一趟 我实在没法提毕业 （说来就来气 丫一般都是每年只度两个月假期的 居然在我四年这么关键的档口上发疯 走了一年） 一折腾 拖到5年上（中间我回国探亲被check 搞了两个多月 后来又因为H1B用光了 为了留个OPT的后路又拖了一下）

论文写完了 下个月答辩 committee不是老板的哥们就是不懂我做的这个具体方向的PHD就要到手了 发现5年就搞明白一个问题 自己不喜欢也不适合（性格上）搞科研 再BS一下自己 按照一个兄弟的话说 虽然拿的两万多块钱不算多 要是算一下真正工作量
的话 其实也不比律师少

实验室的日子估计到头了 发个小文 算是个了结吧 将来的日子 该死鸟朝上 要慢慢闯了

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注意：GFP的不一定

GFP虽然可以荧光，但是其激发、发射波长却不一定。主要是因为一些突变，造成的波长移动。

Wild type GFP from jellyfish has two excitation peaks, a major one at 395 nm and a minor one at 475 nm with extinction coefficient of 30,000 and 7,000 M-1 cm-1, respectively. Its emission peak is at 509 nm in the lower green portion of the visible spectrum. The GFP from the sea pansy exhibits a single major excitation peak at 498 nm. Crystals of GFP exhibits a nearly identical fluorescence spectrum and lifetime to that for GFP in aqueous solution.

For wild type GFP, exciting the protein at 395 nm leads to rapid quenching of the fluorescence with an increase in the 475 nm excitation band. This photoisomerization effect is prominent with irradiation of GFP by UV light. In a wide range of pH, increasing pH leads to a reduction in fluorescence by 395 nm excitation and an increased sensitivity to 475 nm excitation.

Some mutants of the GFP gene have been produced which have increased fluorescence. The major excitation peak has been red-shifted to 490 nm with the emission staying at 509 nm. This is better for use with standard optical filter sets, as the mutant GFPs have excitation range more compatible with the commonly available optical filters. This also is more useful for confocal laser scanning applications. The corrected excitation and emission spectra of GFP and some of its variants (termed as BlueFP, CyanFP, GreenFP and YellowFP variants) are shown here:

关于blast2

使用blast时，一定要检查输出目录的写权限。直接拷贝、untar的目录很可能没有写入权限，却不一定会怀疑到。保险的办法还是chmod -R 755 ./*，不管3721，先能用再说。BTW, 出错的输出是：

[blastall] FATAL ERROR: BlastFormattingInfoNew returned non-zero status

连夜看细胞啊

分子细胞生物学，还有H Yu的论文。似乎H的论文和他以前的某些考题范围还是暗合的。不知道这样押宝是否有意义。

复习有的时候真的像是练功，偶尔也会偷点小懒，悟天和特兰克斯合体时不还在时间和精神的房子里面偷懒么？

费解了

老板的讲义上有关p21等对于CDK们作用的叙述，说“p21他们居然paradoxically正调控了cdk-4,-6”。可是这和教科书上的说法矛盾！考试时到底follow谁的呢？

另一个问题在于14-3-3到底跟cyclin-b啥关系。有待弄明白啊！

准备Presentation还真是折腾人啊。整个下午就没干别的。

传说中ANOVA最难做到的

就是同组样本据之间独立。

好的统计学家说

你只有三个数据, 然后问一个统计学家 :证明这些数据是正态分布的.
好的统计学家不会给你证明,而是会说: 你给我证明它不是正态的.

今晚

窗外警铃大作，
无他，
做实验。

动物房的味道很大

绕过一幢楼都能闻见。

啥叫成熟的实验室？

啥叫成熟的实验室？成熟的实验室的标志就是，要有榔头。即使你的实验室再老，再旧再缺经费，如果让人看到你的实验室里居然还有榔头这样齐全的设施，那么别人当然就会相信你的实验室的专业水准。即便在又老又旧又缺经费的条件下还能备齐榔头这样的设施，那真是多么的专业啊！榔头，一件终极的有用装备，无论是你需要敲下冰箱上的碎冰，还是对离心机进行末日审判或者郁闷的参与针对隔壁的集体pk，对你来说都是不可或缺的。所以，你的实验室最最重要的东西是——榔头。

看来不能偷懒啊

做个midiprep，以为不会有问题，就没留中间几步的sample，结果得到的全都是linear的plasmid，还要从头再来。FT!

看来问题总会出在以为不会出现问题的地方。
BTW，我还是没弄清楚QIAGEN到底怎么读。

Seminar: Leukocyte recruitment to the glomerulus

今天听了来自澳洲(MONASH)的Michael Kuligowski的presentation，讲的是白细胞（确切地说是（嗜）中性粒细胞）在肾小球发生炎症时是如何recruit的。他的研究主要集中在P-selectin的作用上。最后结论是，neutrophil不是直接在肾小球中急速流动的血流中rolling的。嗜中性粒细胞想要在内皮细胞上rolling，需要血小板的p-selectin。实验中用到了数种gene KO鼠，不过讲的比较快，没记住。另外还用了射线杀死骨髓造血干细胞，然后移植血小板，这点儿没太看明白——他们怎么排除其他血细胞的作用的呢？

Plos's interesting symbol

Is this the reason why more than two guys sharing the credit is generally not accepted?

到底Mantoux Test能不能测出是否接种过BCG呢？

也许俺的Mantoux Test皮试是白做了。中国的医疗纪录就是成问题啊。大家为了报销，用过的姓名就都是一箩筐。追查小时候生病时的处方和接种过的疫苗就更是Mission Impossible了。

至于这个问题，还是那个包治百病的理由——个体差异。

http://www.moh.govt.nz/moh.nsf/0/4760DF3580A6F5B5CC256C86006ED394/$File/2.Mantouxtesting.pdf
The effect of BCG vaccination on tuberculin reactivity

• The level of reactivity in a vaccinated person is variable, ranging between 0 and 15 mm. Reversion can occur (eg, the reaction wanes with time).
  

• A Mantoux reaction of > 15 mm induration should not be attributed to BCG vaccination.

• There is no relationship between the post-vaccination Mantoux result and protection against TB disease. Routine post-BCG vaccination tuberculin testing serves no purpose