Wednesday, September 06, 2006

shininglake : 读书偶得

shininglake : 读书偶得:

另一个是关于质粒电泳的三条带。以前看书都说从迁移速度来看最快的是超螺旋,其次是线状,最后是开环。这本书上说后两者的先后顺序是不一定的,很大程度上决定于缓冲液体系和离子强度。该书没有给出参考文献。

其实有些参考书看完以后更加不明确了。比如,最简单的碱裂解法提大肠杆菌质粒,某一个步骤《分子克隆》3rd Ed.上和《Current Protocols》完全相反,一个要强烈震荡,一个说不能震荡。其实,可能都可以做出来。实验么,不违反大的方针,不出现非常奇异的结果,真正有几个人会管你这些protocol的细节呢?

Tuesday, August 29, 2006

节约楷模

发信人: tongjins (腺病毒), 信区: LifeScience
标 题: Re: 请问一下琼脂糖和琼脂粉有什么区别?
发信站: 水木社区 (Tue Aug 29 17:02:10 2006), 站内

呃,以前读硕士的时候很穷,我们这里有牛人用琼脂粉跑电泳的,分离效果差不多,就是染
色出来背景很高....

PS:还有更牛的穷人,用唾液代替蛋白质MARKER......
为那些拼命招生的穷鬼老板脸红一下......
【 在 biotiger (小胡子) 的大作中提到: 】
: 如果实验室钱很多,可以用琼脂糖替代琼脂粉:)
: 但核算电泳就不能用琼脂粉,电泳为了分离效果一定要纯,琼脂粉杂质太多

Monday, August 07, 2006

冷笑话一则

俺蹭某课,
老师讲到:“四种碱基分别是:鸟嘧啶,腺嘧啶,胞嘧啶,胸腺嘧啶”

Orz~.

Sunday, July 23, 2006


在Perl大牛Lincoln Stein的(冷泉港)主页上,有这么一个链接:Reactome - a curated knowledgebase of biological pathways。

这个“反应组”知识库首先直观的表示出目前已知的大多数生物途径。从代谢途径中最重要的三羧酸(TCA)循环,到各种级联的磷酸化途径,包括各种信号转导和细胞周期调控,已知、预测、推测的反应途径。查找需要的信息,只需在图上点击鼠标,或者搜索关键词即可。当然,分类目录还是不能少的。

曾经记得生化课本上有一个代谢途径的总图,复杂程度似乎与此图相当。Reactome结合web浏览器的在线版本,使用起来就更加方便了。不过,由于这个网站的Reactionmap单纯借助于简单的cgi重绘,给人停顿的感觉。若能按照AJAX标准另行构建一个像Google Map一样的地图,似乎可用性能增加不少呢!

注:Lincoln Stein还是CPAN上的GD.pm,CGI.pm的作者。